Непонятый мастер ателье: Обычная история о бывшем помощнике в отряде героя, чьи навыки, кроме боевых, достигли SSS-ранга

События разворачиваются спустя более ста лет после того, как вторжение титанов привело к краху человеческой цивилизации. Остатки человечества выживают в пределах трех концентрических стен, которые защищают их от гигантских гуманоидов. Для борьбы с внешней угрозой созданы Разведывательные войска, члены которых с помощью специального снаряжения ведут операции за стенами. Главный герой, Эрен Йегер, вступает в армию после того, как его родной город разрушен титанами.

В ходе одной из миссий за стеной отряд Эрена сталкивается с неожиданной атакой. В результате этого столкновения Эрен демонстрирует способность превращаться в разумного титана, что вызывает серьезные подозрения у командования. Его помещают под стражу для расследования, так как его лояльность человечеству ставится под сомнение. Ситуация обостряется, когда во время суда над Эреном на город нападает титан в бронированных пластинах.

Появление бронированного титана вынуждает военное руководство временно использовать способности Эрена для защиты. Это событие меняет расстановку сил и заставляет пересмотреть отношение к тем, кто может контролировать превращение в титана. Дальнейшее развитие сюжета сосредоточено на расследовании природы титанов, истинной истории стен и конфликте между различными фракциями внутри оставшегося человечества.